Weiterführende Links

...Biobanken...

• 1. Literatur- und Meta-Suchmaschinen
  - Google
  - Google Scholar
  - Google Books
  - NCBI PubMed
  - Gopubmed
• 2. Datenbanken mit Krankheitsinformationen/ Relevanz für die klinische Genetik
  - OMIM
  - GeneReviews
  - Orphanet
  - NORD
  - EURORDIS
  - Arzneimittelnebenwirkungen (in der Schwangerschaft)
• 3. Datenbanken mit Relevanz für die klassische Zytogenetik / FISH
  - Mendelian Cytogenetics Network
  - ENSEMBL Cytoview
  - Zytogenetik-Atlas (Onkologie)
  - Mitelman-db (Onkologie)
  - SKY/M-FISH, CGH-db (Onkologie)
  - Progenetix (Onkologie)
  - Array-CGH Tumor-db (Onkologie)
• 4. Humanes Genom Annotations-Browser / Analyse-Tools
  - Ensembl
  - UCSC Genome Browser
  - NCBI Map Viewer
  - Galaxy Genome Software
  - Biomart
  - DAS
• 5. Gen-basierte Datenbanken/ Meta-Suchmaschinen:
  - HGNC
  - NCBI Entrez Gene
  - GeneCards
  - Bioinformatic Harvester
  - Genedistiller
  - iHOP
• 6. Genom-Variations Datenbanken / Genotyp-Phänotyp-Korrelation
  - NCBI dbSNP
  - Hapmap
  - Database of Genomic Variants
  - Decipher
  - Segmental duplication db
  - NCBI dbGAP
  - NCBI Genetic Association db
  - Gen2Phen Knowledge Center
  - European Genome-Phenome Archive
  - Welcome Trust Case Control Consortium
  - Human Epigenome Project
  - Human Gene Mutation Database
  - HGVS (Nomenklatur)
  - Mutalyzer (Nomenklatur)
  - Locus reference Genomic (Nomenklatur)

• 7. Gensequenzanalyse-Tools
• 7.1. Sequenzvarianten-Interpretations-Tools
  - Polyphen2
  - SIFT
  - Mutation Taster
  - SNPS3D
  - SNAP
  - Pmut
  - AGVGD
  - Modbase/LS-SNP
  - SNPeffect
  - TopoSNP
  - MutDB
  - pupaSNP
  - FastSNP
  - ssahaSNP
• 7.2. SpliceSite-Vorhersage-Tools
  - HSF
  - ACESCAN
  - Splice Site Prediction (D. melanogaster)
• 7.3. DNA-Sequenzmotiv-Vorhersage-Tools
  - TFSEARCH
  - JASPAR
  - MEME
  - TRAWLER
  - WEEDER
• 8. ausgewählte Gen-/ Proteinfunktions Datenbanken
  - GeneOntology
  - SRS 3d
  - Pfam
  - Expasy
  - PDB
  - FOLDX
  - TOPO2
  - KEGG pathway analysis
  - Proteinatlas
  - 4Dxpress
  - Mitocheck
• Sammlung von Programmen zur statistischen Analyse von genetischen Daten incl. Stammbaunzeichenprogramme
  

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